Scientific Linux является перекомпилированной версией Red Hat Enterprise Linux, разработанной Национальной ускорительной лабораторией им. Энрико Ферми совместно с Европейской организацией по ядерным исследованиям (ЦЕРН). И хотя главной целью разработчиков было создание дистрибутива, полностью совместимого с Red Hat Enterprise Linux, эта версия также дает возможность использовать многие пакеты, недоступные для вышеназванного дистрибутива. Наиболее важными особенностями Scientific Linux является поддержка различных файловых систем, таких как Cluster Suite и Global File System (GFS), FUSE, OpenAFS, Squashfs и Unionfs, встроенная поддержка работы с драйверами беспроводных устройств, а именно программные продукты Intel, MadWiFi и NDISwrapper; Sun Java и Java Development Kit.